化肥商业淡储问题已成为近年来化肥业内的一大热点，虽然有不同的看法，但总体认为化肥商业淡储政策的实施，对促进化肥行业的健康稳定发展，保证化肥市场的淡储旺供；为农业提供质高价稳的肥料、保证农业增产丰收发挥了积极作用，商业淡储是一种比较好的化肥储存模式。
化肥商业淡储制度已实施6年。化肥商业淡储的初衷主要是为了解决化肥常年连续生产、季节使用的市场供需矛盾。近年来，随着化肥供求关系及变化情况，在解决淡旺季供需矛盾的同时，又赋予了新的功能，即利用淡储来调控化肥市场价格。2009年3月，国家发改委、财政部准予黑龙江、新疆、四川等7省市有关商业储备企业将储存的化肥提前投放市场，以平抑当时尿素价格的过快上涨就是个成功例子。
但由于近两年市场供求关系发生较大的变化，行情变化大，农民和基层经销商的购肥观念也发生了一定的变化，使化肥承储企业普遍遇到巨大的挑战，影响了承储企业的积极性。因此业界也呼吁主管部门应尽快解决以下问题：一是要妥善解决淡储风险问题。淡储虽然政策给以贴息，但仍是个商业行为，投资具有一定风险，如果出现了重大亏损，承储企业则无力全部承担，进而会严重影响他们参与商业淡储的积极性，导致国家淡储任务无法完成。二是要鼓励更多的化肥生产企业参与化肥淡储。
化肥商业淡储政策执行的6年中，在吸取生产、流通企业和广大农民意见的基础上也在不断修正和调整。目前，除中央进行淡储外，部分省市（特别是一些种粮大省）乃至地县都建立了地方化肥淡储制度，具体运作方式与中央淡储基本一致，使各级政府手中可供调控的化肥淡储资源进一步增加；化肥储量已增加到1600万吨，约占我国春耕用肥量的四分之一，并加大了生产企业的承储比例；承储期为7个月，增加贴息1.5亿元。
针对近年来化肥市场发生的新变化及在化肥淡储中出现的问题，主管部门也曾表示，将对操作了6年的《化肥淡季商业储备管理办法》及其《补充规定》进行修订并重新发布执行。
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